Séquençage de petits génomes entiers (bactéries, archaea, virus)

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Séquençage de petits génomes entiers (bactéries, archaea, virus)

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Pour le séquençage de génome entier, l'ADN entier est fragmenté (traitement enzymatique et/ou mécanique), suivi d’une ligation aux adaptateurs Illumina. La banque ainsi obtenue contient de nombreux fragments qui sont séquencés un à un, plutôt que de cibler un locus génomique spécifique.

Multiplexage des échantillons (source illumina)

Performances (source illumina)

Modalités d'accès

L’atelier est ouvert à l’ensemble de la communauté.
La plateforme assure un contrôle qualité sur les échantillons fournis par l’utilisateur avant de lancer toute expérimentation et se réserve le droit de les refuser s’ils ne sont pas conformes aux pré-requis définis (cf convention de projet)

Tarification

Sur devis - nous consulter en utilisant le formulaire de contact.

Liens et Réservations

Conde C, Thézé J, Cochard T, Rossignol MN, Fourichon C, Delafosse A , Joly A, Guatteo R, Schibler L, Bannantine J, Biet F. Genetic Features of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Strains Circulating in the West of France Deciphered by Whole-Genome Sequencing. November 2022 Microbiology Spectrum 10(6):e0339222 DOI: 10.1128/spectrum.03392-22

Conde C, Branger M, Cochard T, Rossignol MN, Fourichon C, Delafosse A, Davergne A, Joly A, Ngwa-Mbot D, Journaux L, Guatteo R, Schibler L, Biet F. Draft Genome Sequences of 142 Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Strains Isolated from Naturally Infected Dairy Cattle. Microbiol Resour Announ 2021 Sep 23;10(38) :e0069721. https://doi.org/10.1128/MRA.00697-21

Created by : Sylvain Marthey

Last modified : Mardi 13 Février 2024

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