Le séquençage Amplicon est une approche ciblée pour l’analyse des variations génétiques de régions génomiques spécifiques.

Les régions d’intérêt sont ciblées à l’aide de couples d’amorces spécifiques suivi d’un séquençage NGS des amplicons générés.

De 16 à 1536 cibles peuvent être séquencées en parallèle avec une taille comprise entre 150 pb et 1,5kb selon le protocole de fabrication de banques choisi. Le multiplexage des amplicons permet d’accéder simultanément à nombreuses régions d’intérêt.

Les primers utilisés sont créés à façon soit directement par l’utilisateur en collaboration avec la plateforme soit en collaboration avec la société Illumina via le kit TruSeq Custom Amplicon (TSCA). Possibilité de séquencer jusqu’à 1536 amplicons en parallèle.