La plateforme @bridge vous présente son dernier né : l’atelier cytométrie !

La technologie scRNAseq  Chromium disponible depuis février 2022 sur @BRIDGe demande une   préparation préalable des cellules ou noyaux étudiés. Pour des résultats de qualité, il est primordial de trier les cellules afin d’isoler et ne conserver que les cellules d’intérêt viable. Seule la cytométrie en flux peut garantir une analyse et une séparation des cellules suffisante pour des résultats de qualité en chromium.

Caractériser et trier ses cellules avant de faire des analyses génomiques de cellules uniques permet :

• L’enrichissement des populations cibles permet d’augmenter la profondeur de séquençage finale pour ces cibles
• L’élimination de cellules mortes et débris pour évite les contaminations par de l’ADN/ARN et diminue les coûts utiles NGS

C’est pourquoi, en février 2024 la plateforme a mis en place un plateau de phénotypage et d’isolement de cellules viables en amont des analyses génomiques à l’échelle de la cellule grâce à FANY BLANC, IR GABI référente Cytométrie.

 Cet atelier constitue le chainon manquant entre la microgénomique, la microfluidique et le single cell. Il est équipé de deux cytomètres : l’analyseur MACSQuant Analyzer 16 et d’un trieur de cellules le MACSQuant Tyto cell sorter dont les principales caractéristiques sont listées ci-dessous.

L’analyseur « MACSQuant Analyzer 16 » : flexibilité et haut-débit pour phénotyper les cellules.

• 3 lasers, jusqu'à 16 canaux, conçus pour prendre en charge une gamme variée d'applications
• Flexibilité : large gamme de formats de tubes ou plaques (tubes FACS de 5mL, tubes de 1,5mL, 2mL, 15mL ou 50mL ou plaques 96 puits)
• Débit : 15 000 évènements par seconde
• Numération absolue : peut servir de compteur
• Maintien de température (4°C - 37°C)
• Pré-enrichissement de cellules rares cibles marquées par des billes magnétiques avant de les analyser
• Programmation d’un pipetage automatique (marquages)

Le trieur « MACSQuant TYTO cell sorter »:

• Tri doux des cellules dans un système de cartouches fermées et stériles.
• Intensité de cisaillement légère, basse pression et pas de décompression.
• Simplicité d’utilisation : pas de réglage de l’appareil pour le tri.
• Travail en conditions stériles et sans aérosols, sans risque de contamination.

Après une formation auprès de Claudia, Jérôme et Fany, cet appareil peut vous être proposé à la mise à disposition. N’hésitez pas à les contacter pour toute question à l’adresse mail : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. .