Tests de faisabilité et protocoles en microgénomique

Le plateau de microgénomique apporte son expertise dans le domaine de la microgénomique combinant microdissection laser (LCM) et génomique expressionnelle (qPCR) pour réaliser les tests de faisabilité et protocoles de recherche. Ces collaborations permettent aux utilisateurs d'être en capacité de connaître et analyser le génome exprimé par un type cellulaire donné, dans son environnement tissulaire, ce qui suppose de pouvoir isoler spécifiquement ces cellules et travailler sur de faibles, voire de très faibles, quantités de matériel biologique.

Etapes d'une étude de faisabilité 

1 - Etude d'opportunité
Toute demande de collaboration est formalisée par la rédaction d'une fiche "projet" et son opportunité sera évaluée afin de s'assurer de la faisabilité théorique du projet.

2 - Test de faisabilité
La réalisation du test de faisabilité se déroule en 3 phases successives:

  • Phase "a" Cette phase a pour objectif l'obtention d'une coupe histologique du tissu, objet du test de faisabilité
  • Phase "b" : Traitement de l'échantillon obtenu lors de la phase "a".
  • Phase "c" : Une fois les cellules ou le tissu d'intérêt isolé(es) durant la phase 2, une extraction et une quantification des biomolécules (ADN, ARN et/ou protéines), dont l'intégrité aura été contrôlée, seront réalisées.

3- Analyse et interprétation des résultats :
L’analyse, l’interprétation, la conclusion et la remise au client du rapport final de chaque test de faisabilité constituent une opération conjointe de l’INRA et d’EXCILONE.


Equipements associés : Bioanalyzer 2100, Microdissection laser (Arcturus) et XT, MM France Cryostat NX 50, QuantStudio 12k Flex