Génomique - Digital PCR

La plateforme met à disposition des utilisateurs un équipement de pointe QX200TM Droplet DigitalTM PCR System (Biorad), et les compétences qui permettent la réalisation d’analyses génomiques.

Services du plateau de dPCR  

1. Accès libre : Les équipements sont réservables en ligne après formation assurée obligatoire par le personnel de la plateforme. La gestion des réservations nécessite un compte utilisateur.  Deux espaces sont disponibles : espace "pré-PCR" dédié à la manipulation des réactifs, sauf échantillons et l'espace "PCR" pour le chargement des échantillons.  

2. Service personnalisé : Avec accompagnement ou encadrement réalisé avec l’appui du personnel de la plateforme au cours des différentes phases de l’étude (étude et mise en œuvre du protocole expérimental qui comprend la préparation des échantillons et le contrôle qualité, la dPCR et l’analyse des données), En prestation complète réalisée par le personnel du plateau : prise en charge de l’ensemble des opérations afférentes à une technologie, en tant que prestataire. 

3. Développement et mise en œuvre de nouvelles applications 

Exemple : Mise au point d'un protocole pour la détection et quantification de Bactéries dans un millieu complexe.  

Avantages de la digital PCR  

  • une quantification absolue (en nombre de copies  d’événements rares ou d’analyses qui demandent une meilleure précision que la qPCR 
  • Détecte un nombre très faible de molécules, elle est de fait beaucoup plus sensible que la qPCR conventionnelle. Elle permet en théorie de détecter 1 molécule d’intérêt dans un système complexe de molécules. 
  • Nettement plus précise. La technologie sera d’autant plus précise que le nombre de compartiments, le nombre de microréacteurs sera important. 
  • Moins sensible aux inhibiteurs de PCR et qPCR (lysat cellulaires, extractions à partir de milieux complexes, etc)
  • Compatible avec les amorces qPCR