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Le plateau d'histologie a acquis fin 2014 dans le cadre d'un financement de la CNOC et de la participation des unités MICALIS, BDR et GABI un scanner de lames histologiques capables de lire les lames en fond clair et en fluorescence (Pannoramic SCAN, 3DHISTECH). Il est équipé d'un chargeur de capacité 150 lames, d'une caméra fond clair (CIS VCC-FC60FR19CL) et d'une caméra pour la fluorescence (PCO Edge 4.2) et de deux objectifs Zeiss Plan Apochromat® (x20/0.8 et x40/0.95). Ce scanner vient enrichir les solutions en imagerie proposées par la plateforme MIMA2.
Un scanner de lames d'histologie permet de numériser tout type de préparations déposées sur une lame de verre. Il capture des images suivant 3 axes (en x, y et en z) et les clichés sont ensuite compilés pour obtenir une image virtuelle de très haute définition qui s'affiche sur un écran d'ordinateur.
Le Pannoramic SCAN permet de faire des acquisitions d'images à fond clair (lames histologiques colorées par exemple) et en fluorescence ; dans ce cas, la numérisation de la lame apporte un intérêt majeur car il est possible de visualiser plusieurs fois sa préparation sans crainte du photobleaching (perte irréversible de la fluorescence avec la lumière) et de rechercher la colocalisation de molécules à l'échelle cellulaire, très difficilement accessible par les techniques de coloration (immunohistochimie). De base, le scanner est équipé d'un filtre quatribande permettant de lire les fluorochromes suivants : DAPI/FITC/Tri-TC/Cy5. Il pourra être équipé avec d'autres filtres spécifiques à d'autres fluorochromes.
Ce scanner est équipé d'un système de lecture de code-barre ce qui permettra d'éviter les erreurs de numérisation.
Toutes les lames préparées et colorées par le plateau d'histologie peuvent être numérisées à la demande de l'utilisateur. Le scanner est en libre-service pour la numérisation de vos lames d'immunohistologie et d'hybridation in situ pour tous les utilisateurs ayant suivi une formation. L'appareil est réservable via le site internet de l'équipe plateforme de GABI.
Les lames seront stockées sur un serveur de stockage dédié avec un accès restreint (service disponible courant 2015).
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