Sur demande des utilisateurs, le plateau d’histologie peut mettre en place des colorations spécifiques de certains composants tissulaires.

Ainsi, différentes colorations spécifiques ont déjà été mises en place :
•    Coloration de Weigert
•    Coloration de Bleu Alcian : mise en évidence en bleu les mucopolysaccharides acides
•    Coloration Bleu Alcian + PAS : mise en évidence des mucines acides et neutres
•    Coloration de Trichrome de Masson : mise en évidence du collagène en Bleu
•    Coloration au Rouge à l'huile (oil-red o) : mise en évidence en rouge des triglycérides
•    Coloration à l’Acide périodique-Schiff (PAS) : mise en évidence en rose rouge du glycogène

Les coupes colorées peuvent ensuite être numérisée sur le Pannoramic SCAN.